Las principales especies de peces del río Uruguay, como el sábalo y el dorado, son migratorias; nadan instintivamente contra la corriente, aguas arriba, para desovar. ¿Qué harían con un dique impidiéndoles el paso?.

Se han construido esclusas especiales en la presa para que puedan pasar. En el gráfico se observa como funcionan, abriendo sus compuertas para permitir el paso de los peces.

       Etapa 1: LLamada de peces

      Etapa 2: LLenado de la escala

       Etapa 3: Salida de peces

      Etapa 4: Vaciado de la escala

Pero no solo se tomaron medidas para proteger los peces existentes. Se decidió multiplicar las posibilidades de pesca en el lago, y para ello sembrar pejerreyes y bagres.